清洗擦拭是保持摩托車外表清潔、美觀的主要手段。但清洗擦拭不當，會造成輪圈輻條氧化腐蝕和車身的早期損壞，甚至導致交通事故的發生。
車身和行路部分容量沾上泥土、灰塵及其它髒物。清洗時經常是一邊用水沖一邊用布擦拭，而鐵制的邊車車廂沖洗後不易幹，若長期用水沖洗，車廂底部和行李箱的凹部易積水銹蝕。所以在清洗時，應將摩托車停放在斜坡上，讓泥水從車廂底板前端的小孔流出，避免積水。沖洗後，應立即用布擦乾，保持輪圈輻條和車身內部的乾燥。
制動鼓與鼓蓋的接合部位元容量滲水（盤式制動的制動賀盤更易濺上水）。因為一般摩托車前、後輪的制動鼓都沒有防水裝置，用水沖洗車輪時，水就會直接流到制動蹄片上，造成制動打滑，甚至制動失靈。因此，每次清洗車輪後，就低擋行駛，反復輕踩（握）制動踏板（手柄），利用制動器摩擦副間產生的熱量將水烘乾，直到制動效能恢復為止。
化油器易進水造成故障。用水沖洗車輛時，水滴會從空氣濾清器流入化油器內。啟動時，不被燃燒的水被停留在氣缸內和火花塞電極上，造成啟動困難。當產生高壓電後正遇上火花塞電極短路時，高壓線圈就變成負載，很容易被高壓電擊穿燒毀。幫沖洗車輛時，應用塑膠紙將空氣濾清器、化油器包紮嚴密，避免泥沙和水鑽進氣缸。
由於摩托車發動機無機蓋遮蔽而裸露，沖洗時水就會噴灑在氣缸蓋上的火花塞座孔和其它線路上，導致其竄電、短路，造成發動機工作不良或不易啟動，嚴重時還會引起蓄電池大量放電。所以清洗後應用幹布擦乾火花塞座孔，及各種線路上被灑上的水，放可啟動。
最後，還需注意的是，擦淨點火開關鑰匙眼、里程表和各種燈開關上的水滴，不然也會產生一定的麻煩。
