旅遊者腹瀉的發病機理及臨床表現取決於病原的種類。腹瀉發生的時間大多為抵達旅遊地後3～7天，持續時間平均為3～5天。產腸毒素性大腸桿菌性腹瀉常無發熱和嚴重腹痛，但排便頻繁，呈水樣，可有嘔吐和失水。病毒性腹瀉的大便呈水樣，缺乏特徵性。賈第蟲腹瀉者的潛伏期為1～3周，病程可長達2周以上。沙門氏菌和志賀氏菌感染時，糞便中可見較多白細胞和膿細胞。
一部分患者活動受到明顯的影響，故對旅遊者腹瀉除一般治療外，應根據可能病原進行相應的治療。有效的抗菌药物有复方新诺明、强力霉素及氟喹诺酮类抗生素(如氟哌酸、氟啶酸、氟嗪酸、环丙氟哌酸等)。
对于贾第虫和阿米巴原虫感染大多采用甲硝唑治疗，剂量为每次750mg，每天3次，疗程7～10 天。
外出旅游者预防腹泻的发生，除应注意饮食与饮水外，还应预防性地服用一些抗菌药，如强力霉素、红霉素、复方新诺明等，其有效率可达80%，但应注意小量服用，以防肠道菌群失调和耐药菌株产生。